メディアミックスでの限定で登場したキャラクターのまとめです。
一応時系列順。

アニメBR/DVDスペシャルCD特典 めだかボックスジュブナイル
「第七箱 元会計職・千怒憖」
千怒 憖

小説版めだかボックス上巻
「久々原滅私の腑抜けた君臨 または 啝ノ浦さなぎの足蹴による投票」
  • 黒神めだかが現れた事により振り回される先生達の話

小説版めだかボックス下巻
「朳理知戯のおしとやかな面従 または 椋枝閾の杯盤狼藉マニフェスト」
  • 学園を変えんとするめだかと従来の学園を守ろうとする先生達の戦い

アニメ版一期最終話めだかボックス
「黒神めだかがいなくても!」
  • めだかが雲仙戦の負傷で入院していた頃、生徒会に将棋部から依頼が来る

アニメ版二期最終話グッドルーザー球磨川
「生徒会を死刑執行する」
  • 球磨川が水槽学園の生徒会長になりたての頃、不登校だった画図町筆が現れる

小説版グッドルーザー球磨川上巻
「水槽に蠢く脳だらけ」
  • 安心院なじみを倒すために行動する球磨川に安心院がある試験を課す話

小説版グッドルーザー球磨川下巻
「水槽管理のツークツワンク」
  • 水槽学園で安心院の試験を受ける球磨川に振り回される須木奈佐木咲の話